بعد أن أصدرت نظامها الداخلي، تصدر سوق دمشق للأوراق المالية النظام الداخلي لمركز المقاصة والحفظ المركزي، الذي يحدد الهيكلية الإدارية للمركز ومهام وحدتيه الإداريتين: دائرة التحويل والحفظ المركزي ودائرة التقاص والتسوية، يعتبر المركز الجهة الوحيدة المخولة لتسجيل جميع حقوق ملكية الأوراق المتداولة في السوق، كما يبين النظام الوثائق المطلوبة لنيل عضوية المركز للشركات المساهمة وشركات الخدمات والوساطة المالية. حيث أن عضوية المركز إلزامية بالنسبة لشركات المصدرة للأوراق المالية المدرجة، وشركات الخدمات والوساطة المالية الأعضاء في السوق.